《黑猫警长》动画系列最终只制作完成五集的原因可以归纳为以下几点：
厂内变迁：
1988年之前，上海美术电影制片厂是中国唯一的专业动画生产厂家，没有市场压力。但随着电视市场的逐渐成型，外资动画制作公司成立，北电厂人才流失，美影厂面临人才缺失和生产能力下降的问题。
版权纠纷：
1987年，《黑猫警长》的童话作者诸志祥与戴铁郎之间发生了版权纠纷，这可能影响了动画的制作和续作。
创作人员变动：
美影厂内部发生人员大变动，许多老员工离开，导致创作人员结构出现断层，影响了动画的制作。
市场和审查因素：
当时动画内容可能被认为过于血腥、恐怖，有家长投诉，加上审查制度的影响，这些都可能是导致动画停止制作的原因。
初始剧本限制：
最初，《黑猫警长》的总导演戴铁郎只准备了5集的剧本，而拍摄到第二集时，有专家建议不要再继续拍摄。
经济因素：
由于《黑猫警长》并不盈利，在当时的条件下，继续制作动画的经济压力较大。
以上几点综合起来，导致了《黑猫警长》动画系列最终只制作完成五集。
